Agenția de Guvernare Electronică garantează respectarea drepturilor titularilor datelor cu caracter personal prevăzute de Legea nr. 133 din 08.07.2011 privind protecția datelor cu caracter personal. Agenția de Guvernare Electronică este înregistrată în calitate de operator de date cu caracter personal, fapt ce poate fi verificat pe portalul registru.datepersonale.md.
